Die frühesten Berichte über den Heiligen Johannes Nepomuk stammen bereits aus dem späten 14. und frühen 15. Jahrhundert.

Johannes von Pomuk war Generalvikar unter Erzbischof Johann von Jenstein in Prag. Er geriet in Konflikt mit König Wenzel IV. von Böhmen, insbesondere aufgrund kirchlicher Angelegenheiten und politischer Spannungen zwischen dem Erzbischof und dem König.

Die frühesten Aufzeichnungen beschreiben, dass Johannes von Pomuk im Zusammenhang mit einer Auseinandersetzung über die Ernennung eines Abtes für das Kloster Kladruby gefangen genommen, gefoltert und schließlich getötet wurde.

Am 20. März 1393 wurde Johannes von Pomuk festgenommen und gefoltert. Nach seiner Weigerung, den Forderungen des Königs nachzugeben, wurde er in die Moldau geworfen, wo er ertrank. Diese Ereignisse sind in mehreren Chroniken aus jener Zeit dokumentiert, darunter die Chronik von Beneš Krabice von Weitmühl.